Klīniski acīmredzama varš deficīts ir salīdzinoši reti. Serums varš un tā glabāšanas forma ar koeruloplazmīns transporta olbaltumvielas var samazināties līdz 30% no normālā līmeņa, pirms attīstās klīniskie simptomi. Viena no visbiežāk sastopamajām varš trūkums ir anēmija (anēmija) un visi saistītie bāluma un nogurums. Šī forma anēmija nereaģē uz dzelzs terapija, bet to var labot, pievienojot varu. Tiek pieņemts, ka šajā gadījumā dzelzs transports ir traucēts zema līmeņa dēļ koncentrācija of koeruloplazmīns. Vara trūkums var arī traucēt leikocīti (balts asinis šūnas) un izraisīt tā dēvēto neitropēniju. Tas skartajiem indivīdiem ir vairāk uzņēmīgs pret infekcijām. Osteoporoze un citas kaulu attīstības novirzes vara deficīta dēļ radušās zīdaiņiem un maziem bērniem.
Retāk vara deficīta pazīmes var būt pigmentācijas traucējumi, neiroloģiski simptomi un augšanas traucējumi.
