DNS sekvencēšana
DNS sekvencēšanā tiek izmantotas bioķīmiskās metodes, lai noteiktu nukleotīdu (DNS bāzes molekulas ar cukuru un fosfātu) secību DNS molekulā. Visplašāk izmantotā metode ir Sangera ķēdes pārtraukšanas metode. Tā kā DNS sastāv no četrām dažādām bāzēm, tiek veiktas četras dažādas pieejas.
Katra pieeja satur sekvencējamo DNS, grunti (sekvencēšanas sākuma molekula), DNS polimerāzi (enzīms, kas izpleš DNS) un visu četru nepieciešamo nukleotīdu maisījumu. Tomēr katrā no šīm četrām pieejām atšķirīga bāze tiek ķīmiski modificēta tādā veidā, ka to var iekļaut, bet nenodrošina DNS polimerāzes darbības punktu. Pēc tam tas noved pie ķēdes pārtraukšanas. Šī metode ražo dažāda garuma DNS fragmentus, kurus pēc tam ķīmiski atdala ar tā saukto gēla elektroforēzi atbilstoši to garumam. Iegūto šķirošanu var pārveidot nukleotīdu secībā secīgajā DNS sadaļā, marķējot katru bāzi ar atšķirīgu fluorescējošu krāsu.
DNS hibridizācija
DNS hibridizācija ir molekulārā ģenētiskā metode, ko izmanto, lai pierādītu divu atšķirīgas izcelsmes atsevišķu DNS virkņu līdzību. Šī metode izmanto faktu, ka DNS dubultā virkne vienmēr sastāv no diviem komplementāriem atsevišķiem pavedieniem. Jo abas viengabalainības ir līdzīgākas viena otrai, jo vairāk bāzes veido cietu savienojumu (ūdeņraža saites) ar pretēju bāzi vai arī veidojas vairāk bāzes pāru.
Starp divu DNS virkņu sekcijām, kurām ir atšķirīga bāzes secība, bāzes savienojumi nepastāv. Relatīvo savienojumu skaitu tagad var noteikt, nosakot kušanas temperatūru, kurā atdalīta jaunizveidotā DNS dubultā virkne. Jo augstāka kušanas temperatūra, jo vairāk savstarpēji papildinošās bāzes ir izveidojušas ūdeņraža saites un jo līdzīgāki ir abi atsevišķie pavedieni. Šo metodi var izmantot arī, lai noteiktu noteiktu bāzes secību DNS maisījumā. Šim nolūkam mākslīgi izveidotus DNS fragmentus var marķēt ar (fluorescējošu) krāsu. Tad tie kalpo atbilstošās bāzes secības atzīmēšanai un tādējādi var padarīt to redzamu.
Visi šīs sērijas raksti:
