Ķirurģiska terapija var būt nepieciešama sarežģītas, pārmērīgas C. difficile infekcijas (CDI) gadījumā:
- Zarnu perforācija - plīsums kols siena (zarnu perforācija).
- smags terapija- ugunsizturīgi kursi, īpaši ar ileusu (zarnu aizsprostojums) vai toksisks megakolons - masveida paplašināšanās (izplešanās) vai palielināšanās kols iekaisuma kontekstā.
Agrīna operācija var samazināt sarežģītās CDI letalitāti (mirstība, kas saistīta ar kopējo cilvēku skaitu, kas cieš no šīs slimības)! Standarta ķirurģija fulminanta, ugunsizturīga CDI gadījumā joprojām ir starpsumma kolektomija (nav pilnīga zarnu ķirurģiska noņemšana) ar terminālo ileostomiju (mākslīgā zarnu izeja).