Blakusefekti
Blakusparādības klonidīnu ir izskaidrojami ar α2 receptoru lokalizāciju. α2 receptori ir atrodami ne tikai autonomā simpātiskajā daļā nervu sistēmas, bet arī, piemēram, asinis kuģi. Tas var izraisīt asinsrites traucējumus, īpaši, mainot ķermeņa stāvokli no gulēšanas uz stāvēšanu (ortostatiskas disfunkcijas), samazinoties asinis spiediens.
Tas var būt ne tikai receptoru aktivācijas rezultāts kuģi, bet arī simpātijas aktivitātes samazināšanās rezultāts nervu sistēmas, kas pēc tam noved pie simpātiskā pretinieka relatīvā pārsvara, jo parasimpātiskā daļa netiek ietekmēta. Šis aspekts arī noved pie nevēlamām sekām, piemēram, sausa mute. Citas blakusparādības var būt nogurums un samazināta veiktspēja. Pēc pēkšņas zāļu lietošanas pārtraukšanas klonidīnu, var rasties pārpilna reakcija ar pretēju efektu (atsitiena parādība).
