Sākotnēji ārstējošais ārsts ar DSO (Deutsche Stiftung Organtransplantation) koordinatora atbalstu apsvērs iespēju niere transplantācija, ja ir norāde. Pēc tam pacients tiek anonīmi reģistrēts Nīderlandes starpniecības centrā Eurotransplant, kur viņš vai viņa ir iekļauta gaidīšanas sarakstā, lai laika gaitā saņemtu donora orgānu. Saņēmēju izvēlas Eurotransplant, par orgānu izņemšanu un transportēšanu rūpējas DSO.
Vidējais gaidīšanas laiks, kad ziedo auniniekus niere transplantācija ir no pieciem līdz sešiem gadiem un ir atkarīga no dažādiem kritērijiem. Orgāni tiek piešķirti, pamatojoties uz punktu sistēmu (ETKAS = Eurotranplant Nieres Allocation System), kas ietver audu atbilstību starp donoru un saņēmēju (HLA savietojamība), asinis grupas savietojamība, medicīniskā steidzamība, gaidīšanas laiks, noteiktu klātbūtne antivielas iekš asinis (PRA = paneļa reaktīvās antivielas), kā arī attālums starp donora reģionu un saņēmēja centru. Vācijā ir orgānu donora karte, kas ļauj cilvēkiem pirms nāves izlemt, vai viņi vēlas tikt uzskatīti par donoriem vai nē.
Pirms nieru transplantācija, pacientam jāsaņem pietiekama aizsardzība pret vakcināciju gan līķu, gan dzīvu ziedojumu gadījumā, kas ietver poliomielītu, difterija, stingumkrampji, hepatīts B, pneimokoku un gripa. Šīs vakcinācijas ir nepieciešamas pirms a nieru transplantācija, jo pacients saņem zāles, lai nomāktu imūnā sistēma (imūnsupresīvi medikamenti) pēc orgānu ziedošanas. Tas arī palielina risku saslimt ar bakteriālām vai vīrusu infekcijām, kuras var novērst ar vakcināciju.
Cilvēki, kas ir tuvu saņēmējam (piemēram, radinieki), var ziedot vienu no savām nierēm (dzīvs ziedojums). Personiskās attiecības ir priekšnoteikums, lai ētikas padome apstiprinātu dzīvo ziedojumu, lai izslēgtu finansiālus iemeslus kā ziedojuma cēloni. Pat dzīvu ziedojumu gadījumā donoram ir jāatbilst noteiktiem veselība kritērijiem, un tiem jābūt asinis grupas saderība, kā arī audu savietojamība (HLA savietojamība) starp donoru un saņēmēju, lai veiktu a nieru transplantācija iespējams.
Ja pacientam tiek piešķirts orgāns - kadaverisks vai dzīvs - tas parasti tiek ķirurģiski pārvietots kopā ar urīnvada uz noteiktu iegurņa reģionu - fossa iliaca (fossa = bedre). Nieru asinis kuģi pēc tam tiek sašūtas kopā un (jaunais) urīnvada ir savienots ar urīnpūslis. Izņemot īpašus gadījumus, nieru laikā organismā atstāj paša saņēmēja nieres transplantācija.
Vairumā gadījumu transplantētais orgāns sāk darboties operācijas laikā. Pēc operācijas profilaktiskas zāles pret noteiktiem patogēniem (Pneumocystis jiroveci, citomegalovīrusa) un tiek veikta imūnsupresīvā terapija visa mūža garumā ( imūnā sistēma) ir sākta. Pēdējais ietver steroīdu, kalcineurīna inhibitoru, purīna sintēzes inhibitoru un proliferācijas inhibitoru lietošanu, kas visi ir imūnsupresīvi medikamenti ar dažādiem darbības veidiem.
